Jack reprend connaissance après la bombe sur la plage. Sayid est à ses côtés et lui explique que le faux Locke lui a sauvé la vie. Celui-ci arrive et annonce à Jack que les autres survivants se sont fait enlever par Widmore et qu’il faut les libérer pour ensuite prendre l’avion. Jack accepte de les aider mais prévient le faux Locke qu’il ne quittera pas l’île.
Hurley, Sawyer, Kate, Claire, Sun et Jin sont emmenés par les hommes de Widmore dans les cages de l’Initiative Dharma. Sawyer refuse d’y entrer mais Widmore menace de tuer Kate s’il ne s’exécute pas. Il ajoute que Kate ne lui est pas indispensable et qu’elle peut mourir. Ils entrent donc dans les cages et Sawyer explique à Kate que Widmore a raison car il a vu son nom barré dans la grotte. Widmore leur affirme qu’il les enferme pour les protéger. Il demande ensuite à ses hommes si la barrière de protection est en place, sachant qu’ « il » arrive.
Plus tard, le courant est coupé et la fumée noire apparaît. Elle tue tous les hommes de Widmore. Jack en profite pour ouvrir les cages et libérer les survivants. Il explique à Kate, stupéfaite, qu’il est avec le faux Locke. Tout le groupe se dirige vers l’avion. Le faux Locke arrive avant eux et trouve dans la cabine de l’appareil des explosifs cachés. Il débranche le dispositif et prend avec lui l’explosif. Quand le groupe arrive, le faux Locke leur explique que Widmore cherche à tous les ressembler pour les tuer. Il leur montre l’explosif et propose de quitter l’île à bord du sous-marin de Widmore.
En chemin vers le sous-marin, Sawyer demande à Jack de l’aider à se débarrasser du faux Locke à qui il ne fait pas confiance. Arrivés sur les docks, ils se font tirer dessus par les hommes de Widmore. Le faux Locke échange discrètement son sac contre celui de Jack et tout le monde se précipite vers le sous-marin. Jack jette le faux Locke à l’eau comme Sawyer lui avait demandé et Kate se fait tirer dessus. Jack se précipite vers elle et se voit obligé de monter dans le sous-marin pour la soigner. Claire maintient à distance les hommes de Widmore avec son fusil, ce qui l’empêche de monter dans le sous-marin. Le sous-marin s’éloigne du ponton avec Sawyer, Sun, Jin, Jack, Kate, Hurley, Sayid et Lapidus à bord. Jack ouvre son sac pour soigner Kate mais découvre l’explosif avec une minuterie. Il comprend le plan du faux Locke qui avait tout prévu. Le sous-marin est déjà sous l’eau, l’ordre est donné de vite remonter. Tandis que Sayid tente de désactiver la bombe, Jack comprend que le faux Locke avait prévu que Sawyer déciderait de l’évincer. Sayid pense savoir comment désamorcer la bombe mais au moment où Sayid est sur le point de débrancher les câbles, Jack s’interpose. Il est persuadé que la bombe n’explosera pas s’ils n’y touchent pas car le faux Locke ne peut pas les tuer. Il explique que le faux Locke a besoin qu’ils soient morts pour quitter l’île, pour ça il veut que les survivants s’entretuent en touchant à la bombe. Sawyer ne croit pas un mot de la théorie de Jack et débranche les câbles. Le décompte de la minuterie s’accélère. Sayid se dépêche de raconter à Jack que Desmond est dans un puits et que le faux Locke veut le tuer. Il s’empare de la bombe et court dans un couloir du sous-marin. La bombe explose et le sous-marin commence à couler. Sun est coincée par du métal et ne peut pas s’échapper. Sawyer, assommé, est inconscient. Jack est obligé de le porter et Hurley se charge d’aider Kate. Jin reste avec Sun et essaye de la dégager. Sun comprend qu’il n’y arrivera pas et lui demande de la laisser. Jin refuse de l’abandonner. Le niveau d’eau monte et ils meurent tous les deux noyés.
Sur la plage, Kate et Hurley s’effondrent en larmes quand Jack leur apprend leur mort. Jack tombe à genou et se met lui aussi à pleurer.
Claire, restée sur le ponton, pense comme le faux Locke qu’ils sont tous morts.
Dans la réalité alternative, Locke se réveille après son opération auprès de Jack, son chirurgien. Ce dernier affirme qu’il est capable de l’opérer et de lui rendre l’usage de ses jambes, mais Locke refuse. Helen entre, folle d’inquiétude et se montre très reconnaissante envers Jack.
Jack cherche à comprendre pourquoi Locke persiste à vouloir rester paralysé. Il rend visite au dentiste de Locke qui lui a refait les dents suite à un accident. Il rencontre alors Bernard qui lui explique que lors de l’accident, Locke était avec un autre homme, Anthony Cooper. Jack se rend dans l’hospice où vit Anthony Cooper et découvre un homme handicapé mental et physique. Helen lui avoue qu’il s’agit du père de Locke. Jack retourne voir Locke qui lui explique qu’il est responsable de l’état de son père car il pilotait l’avion qui s’est crashé avec à bord son père. Jack tente de le convaincre que se punir ne ramènera pas son père et qu’il doit vivre sa vie.
